| 2006年1月、アヤックスと契約を結んだ。 |
| へーレンフェーンには900万ユーロの移籍金と活躍に応じたインセンティブが支払われることになり、そのうちの15%（135万ユーロ）はPSVへ渡った。 |
| 冬期中断明けにアヤックスでのデビューを飾ったフンテラールは、2006年2月5日のKNVBカップで古巣ヘーレンフェーンを相手に移籍後初ゴールを決めた。 |
| 2月の間、7試合で9得点という活躍をみせ、セリエA・インテル・ミラノ戦でUEFAチャンピオンズリーグに初出場した。 |
| アヤックス移籍後のリーグ戦16試合で、チームトップの16得点を叩き出し、シーズン合計33得点の成績でエールディヴィジ得点王に輝いた。 |
| このシーズンは公式戦47試合で44ゴールを記録した。 |
| 2位でシーズンを終えたアヤックスは、プレーオフでフェイエノールト。 |
| KNVBカップ準決勝ではフンテラールのバイシクルゴールを含む2得点もあり、アヤックスは4対1でローダJCに勝利した。 |
| 決勝は古巣PSVとの対戦となったが、フンテラールはここでも2得点の活躍を見せ、アヤックスは2対1で勝利を収めた。 |
| これらの活躍からフンテラールは2005-06シーズンのオランダ最優秀選手、アヤックス最優秀選手に輝いた。 |
| 2006年7月、デニス・ベルカンプの引退記念試合に出場し、この試合がこけら落としとなったアーセナルの新スタジアム（エミレーツ・スタジアム）での最初のゴールを挙げた。 |
| そして2006-07シーズンはアヤックスの副主将としてシーズンを迎えた。 |
| UEFAチャンピオンズリーグ予選3回戦ではコペンハーゲンと対戦。 |
| アウェイでの1stレグではフンテラールの2得点もあり2対1で勝利するが、ホームでの2ndレグで敗れてトーナメントから姿を消した。 |
| アヤックスはUEFAカップに回るが、3回戦でブレーメンに敗れた。 |
| フンテラールは7試合に出場、7得点を記録した。 |
| エールディヴィジでは21得点を挙げた。 |
| アヤックスは2位でシーズンを終え、前年に続きプレーオフを勝ち抜き、チャンピオンズリーグ出場権を獲得した。 |
| フンテラールはプレーオフ準決勝のヘーレンフェーン戦で2つのゴールを決めた。 |
| KNVBカップでは6試合で4得点を記録した。 |
| 決勝のAZ戦では1対1のまま決着がつかず、PK戦を8対7で制したアヤックスがKNVBカップ2連覇を達成した。 |
| フンテラールは2006-07シーズンの全公式戦で51試合に出場し、36得点を記録した。 |
| 2007-08シーズンはルイス・スアレスという新たなパートナーを得るが、チャンピオンズリーグでは再び予選で敗退した。 |
| フンテラールはスパルタ・プラハ戦の1stレグでペナルティーキックを外す失敗を犯している。 |
| アヤックスはUEFAカップでもアウェイゴールの差でNKディナモ・ザグレブを相手に敗退。 |
| フンテラールは2ゴールを挙げるも、アヤックスはヨーロッパの舞台から早々に姿を消した。 |
| エールディヴィジでは昇格組のデ・フラーフスハップ戦（8対1で勝利）での4得点を手始めにゴールを量産した。 |
| 2007年10月のヤープ・スタム引退後は、故障中のエドガー・ダーヴィッツが復帰するまで一時的に主将を務めた。 |
| 2008年4月6日、デ・フラーフスハップとの2回戦は再びアヤックスが4対1で勝利した。 |
| この試合でハットトリックを達成したフンテラールは、同時にエールディヴィジ通算100ゴールを達成した。 |
| 25歳以下での100ゴール達成はデニス・ベルカンプ、ディルク・カイトに次いで3人目の記録であった。 |
| フンテラールはこのシーズン、34試合の出場で33得点を挙げ、エールディヴィジの得点王に輝いた。 |
| また、アヤックスではマルコ・ファン・バステンが1986-87シーズンに記録して以来、21年ぶりの30得点達成となった。 |
| 2008-09シーズン、そのマルコ・ファン・バステンが監督に就任すると、フンテラールは主将の任を受けた。 |
| 2008年11月のスパルタ・ロッテルダム戦で足首の靱帯を負傷するまで、15試合の出場で9つのゴールを決めた。 |
| この負傷で8週間の離脱を余儀なくされ、結果的にこの試合がアヤックスでのラストゲームとなった。 |
