| 康和5年（1103年）、大江匡房の名付により「忠通」と称する。 |
| 嘉承2年（1107年）、元服し白河法皇の猶子となる。 |
| 永久2年（1114年）白河法皇の意向により法皇の養女の藤原璋子（閑院流藤原公実の娘）との縁談が持ち上がるが、璋子の素行に噂があったこともあり、父忠実はこの縁談を固辞し破談となる。 |
| 保安2年（1121年）、白河院の勅勘をこうむり関白を辞任した父忠実に代わって藤原氏長者となり、25歳にして鳥羽天皇の関白に就任。 |
| その後も崇徳・近衛・後白河の3代に渡って摂政・関白を務めることとなった。 |
| 摂関歴37年は高祖父藤原頼通の50年に次いで2位である。 |
| また太治4年（1129年）、正妻腹の娘藤原聖子を崇徳天皇の後宮に女御として入内させ摂関家からは藤原寛子（藤原頼通の娘）以来約80年ぶりの入内。 |
| なお、養女を含めると、白河天皇中宮藤原賢子（藤原師実養女、実は源顕房の娘）以来で56年ぶりとなる。 |
| 、翌太治5年（1130年）、聖子は中宮に冊立された。 |
| 崇徳と聖子との夫婦仲は良好だったが子供は生まれず、保延6年（1140年）9月2日女房兵衛佐局が崇徳の第一皇子重仁親王を産むと、聖子と忠通は不快感を抱いたという『今鏡』第八、腹々の御子。 |
| 保元の乱で崇徳上皇と重仁親王を敵視したのもこれが原因と推察される。 |
| 一般には父忠実が弟の頼長を寵愛する余り、摂政・関白の座を弟に譲るように圧力をかけられたように言われているが、実際には長い間、摂関家を継ぐべき男子に恵まれず正妻の藤原宗子との間には男子が生まれたが夭折。 |
| また、妾腹の男子に恵信（1114年生）・覚忠（1118年生）がいたが、いずれも出家している。 |
| この2人に対しては、正妻宗子が良い感情を抱いていなかったようであり（『今鏡』）、2人の出家については宗子への配慮または彼女自身の意図に依るものであることを窺わせる。 |
| 、天治2年（1125年）に23歳年下の頼長を一度は養子に迎えている。 |
| だが、40歳を過ぎてから次々と男子に恵まれるようになった忠通が実子に摂関家を相続させるため、頼長との縁組を破棄したのである。 |
| 忠通と忠実・頼長は近衛天皇の後宮政策においても対立し、久安6年（1150年）正月に頼長が養女藤原多子を入内させ、皇后に冊立させたのに対し、忠通もその3ヵ月後にやはり養女藤原呈子を入内させて、中宮に冊立させた。 |
| この呈子立后にとうとう忠実・頼長は業を煮やし、忠通は同年父から義絶されて弟頼長に氏長者職を譲らされるが、多子と天皇の接触を妨害する事などで対抗し、久寿2年（1155年）の後白河天皇の践祚により復権。 |
| それら一連の対立が保元の乱一つの原因となった。 |
| 乱後、氏長者の地位は回復されたが、その際に前の氏長者である頼長が罪人でかつ死亡していることを理由として、宣旨によって任命が行われ、藤原氏による自律性を否認された。 |
| 更に忠実・頼長が所有していた摂関家伝来の荘園及び個人の荘園が全て没官領として剥奪されることになったが、忠通が忠実に摂関家伝来のものと忠実個人の荘園を自分に譲与するように迫り、漸く忠通の所領として認められて没収を回避された。 |
| 保元3年（1158年）の賀茂祭の際に院近臣の藤原信頼との対立を起こしたことから後白河天皇より閉門に処せられて事実上失脚、同年に関白職を嫡男の近衛基実に譲った後、応保2年（1162年）に法性寺別業で出家して円観と号した。 |
| 忠通は晩年身近に仕えていた女房の五条（家司・源盛経の娘）を寵愛していたが、長寛元年（1163年）末か翌年の年初頃、五条が兄弟の源経光と密通、これを目撃した忠通は直ちに経光を追い出す（『明月記』）ものの、精神的な衝撃もありまもなく薨去したという角田文衛『平安の春』講談社学術文庫、1999年、226頁。 |
| 忠通が氏長者となった時は既に摂関政治は形骸化し、さらに父や弟との対立を抱え、男子を儲けるのも遅い方であったが、そのような悪い状況の中でも本来対抗勢力である鳥羽法皇や平氏等の院政勢力と巧みに結びつき、保元の乱に続く、平治の乱でも実質的な権力者信西とは対称的に生き延び、彼の直系子孫のみが摂家として原則的に明治維新まで摂政・関白職を独占する事となった。 |
| もっとも、基実の後継者として藤原信頼の妹が生んだ近衛基通ではなく、娘・皇嘉門院（聖子）の猶子となっていた庶子（三男）の兼実を後継者にすることを意図したものの、基実の急死による挫折（次男松殿基房の関白任命や平氏一族による基通後見の成立などの事態の急変）がその後の摂関家分裂の原因となったとする説もある山田彩起子『中世前期女性院宮の研究』思文閣出版、2010年、222-223・256・263頁。 |
| 悪辣な陰謀家とする説があるが（角田文衛など）、異論もある（元木泰雄など）。 |
| 詩歌にも長じ、書法にも一家をなして法性寺様といわれた。 |
| 漢詩集に『法性寺関白集』、家集に『田多民治集』がある。 |
| 日記に『玉林』があるが散逸してほとんど現存しない。 |
