| 暗黒神話(週刊少年ジャンプ1976年20-25号)。 |
| 暗黒神話(1977年2月、ジャンプスーパーコミックス、創美社)。 |
| 暗黒神話(1988年6月、ジャンプスーパーエース、創美社)ISBN9784420137034。 |
| 徐福伝説(月刊少年ジャンプ1979年増刊1月号)。 |
| 解説エッセイタケカワユキヒデ「古代人としての作者」-->。 |
| 夢みる機械(短編集)。 |
| 夢みる機械(1978年6月、サンコミックス、朝日ソノラマ)ISBN9784257914853。 |
| 夢みる機械(1993年8月、ジャンプスーパーエース、創美社)ISBN9784420137508。 |
| アダムの肋骨(短編集)。 |
| アダムの肋骨(1978年9月、奇想天外コミックス、奇想天外社)。 |
| アダムの肋骨諸星大二郎傑作短編集(1982年10月、ジャンプスーパーコミックス、集英社)。 |
| 孔子暗黒伝(週刊少年ジャンプ1977年50号-1978年9号)。 |
| 孔子暗黒伝全2巻(赤気篇・東夷篇)(1978年、ジャンプスーパーコミックス、集英社)。 |
| 孔子暗黒伝(1988年5月、ジャンプスーパーエース、集英社)ISBN9784420137010。 |
| 徐福伝説(短編集、『マッドメン』収録)(1979年3月、ジャンプスーパーコミックス、集英社)。 |
| コンプレックス・シティ(デビュー作『ジュン子・恐喝』収録)(1980年10月、アクションコミックス、双葉社)ISBN9784575930825。 |
| マッドメンシリーズ全2巻(オンゴロの仮面・大いなる復活)(1981-1982年、少年チャンピオンコミックス秋田書店)ISBN9784253037785他。 |
| マッドメン(1985年10月、秋田コミックスセレクト、秋田書店)ISBN9784253108508。 |
| マッドメン諸星大二郎作品集(1993年5月、中公愛蔵版、中央公論社)ISBN9784120022142。 |
| マッドメン全2巻(オンゴロの仮面・大いなる復活)(2000年、ジャンプスーパーエース、創美社)ISBN9784420137690他。 |
| MUDMEN 最終版(2010年1月、光文社コミック叢書SIGNAL、光文社)ISBN9784334901677。 |
| 地獄の戦士(1981年3月集英社、ヤングジャンプ・コミックス、集英社)ISBN9784088611051。 |
| 西遊妖猿伝全9巻-未完(1984-1995年、アクションコミックス、双葉社)ISBN9784575812695他。 |
| 西遊妖猿伝全16巻-未完(1998-2000年、希望コミックス、潮出版社)ISBN9784267903151他。 |
| 西遊妖猿伝大唐篇全10巻(2009年、モーニングKCDX、講談社)ISBN9784063756616他。 |
| 西遊妖猿伝西域篇続刊中(2009年-、モーニングKC、講談社)ISBN9784063728088他。 |
| 子供の王国諸星大二郎珠玉短編集(1984年8月、ジャンプ・コミックスデラックス、集英社)ISBN9784088581231。 |
| 砂の巨人(1984年10月、デュオセレクション、朝日ソノラマ)ISBN9784257900542。 |
| 失楽園(『生物都市』収録)(1988年5月、ジャンプスーパーエース、創美社)ISBN9784420137027(関連:失楽園)。 |
| 諸怪志異(一)異界録(1989年6月、アクションコミックス、双葉社)ISBN9784575931662。 |
| 諸怪志異(二)壷中天(1991年3月、アクションコミックス、双葉社)ISBN9784575932461。 |
| 無面目・太公望伝(1989年8月、希望コミックス、潮出版社)ISBN9784267901928。 |
| 夢の木の下で(『壁男』収録)(1998年7月、MAGコミックス、マガジンハウス)ISBN9784838709700。 |
| 碁娘伝(2001年10月、希望コミックス、潮出版社)ISBN9784267904011。 |
| 私家版鳥類図譜(2003年3月、KCデラックス、講談社)ISBN9784063346947。 |
| トゥルーデおばさんグリムのような物語(2006年2月、眠れぬ夜の奇妙な話コミックス、朝日ソノラマ)ISBN9784257905462。 |
| 私家版魚類図譜(2007年3月、KCデラックス、講談社)ISBN9784063722789。 |